三航脑科学和脑技术研究中心下设八个技术单元实验室，为三航脑科学与脑技术交叉学科的发展做技术支撑：

l 脑机接口开发与应用实验室（Lab for BCI Development and Application）

l 神经生物学实验室（Neurobiological Lab）

l 神经组织与类器官培养实验室（Lab for Neural Tissue and Organoid Culture）

l 动物模型与行为学实验室（Lab for Animal Model and Behavior）

l 地面模拟人工重力实验室（Lab for Ground-Based Artificial Gravity Simulation）

l 人工智能模型开发与应用实验室（Lab for AI Model Development and Application）

l 认知心理与神经调控实验室（Lab for Cognitive Psychology and Neuromodulation）

l 脑电室（EEG room）